Постановлением № 125 Совета Народных Комиссаров от 20 января 1939 г. «Об организации Башкирской государственной филармонии» была создана Башкирская государственная филармония.

Изначально здание Башгосфилармонии представляло собой каменное двухэтажное строение (бывшая Синагога), находящееся на улице Гоголя. Этот архитектурный комплекс начал сооружаться в 1930-х гг. после закрытия еврейского молельного дома, который в течение 15 лет располагался в помещении нынешнего центрального фойе. В 1931 г. началось кардинальное переустройство здания, которое стало называться «Клуб имени М.С. Погребинского» (руководитель НКВД БАССР). В течение 30-х гг. бывший молельный зал и 2-хэтажный жилой дом «кирпичного стиля» весьма удачно в архитектурном отношении были встроены в одно большое здание, оказавшись обустроенными со всех сторон новыми стенами и помещениями. Родился уникальный для Уфы новый театральный комплекс, в котором находились Башгосфилармония и Русский драматический театр.

Приказом Министерства культуры БАССР № 208 от 14 сентября 1982 г., в связи со строительством нового здания для Русского драматического театра, произведена передача старого здания и оборудования (кресла и световая техника) Русского театра на баланс Башкирской государственной филармонии.

Здание по улице Гоголя в г. Уфе, в котором размещается Башгосфилармония, Распоряжением Совета Министров Республики Башкортостан от 3 марта 1992 г. № 158-Р и Указом Президиума Верховного Совета Республики Башкортостан «О сохранении историко-культурного наследия народов Республики Башкортостан» от 12 мая 1992 г. № 6-2/251-В, поставлено на государственную охрану республиканского значения как памятник архитектуры конца XIX вв. (Охранное обязательство по недвижимому памятнику истории и культуры № 0/14 от 19 ноября 1998г.).

Целью создания Башкирской государственной филармонии стало формирование и удовлетворение духовных потребностей населения республики в сценическом, музыкальном, хореографическом искусстве; широкая пропаганда лучших образцов русской и европейской музыкальной и литературной классики, музыки народов республики, народного творчества и произведений современных композиторов и писателей среди народных масс.

На сегодняшний день Башкирская государственная филармония имеет два концертных зала: Малый (Органный), рассчитанный на 300 мест, и Большой зал на 633 места.